Если вы продавец, то НДС при списании дебиторской задолженности по отгруженным, но не оплаченным товарам (работам, услугам) списывайте так же, как и саму задолженность — во внереализационные расходы по налогу на прибыль либо за счет резерва по сомнительным долгам. Если вы покупатель, то входной НДС по авансу, уплаченному за товары (работы, услуги), которые вы так и не получили, списывайте также вместе с самим долгом. Если входной НДС вы принимали к вычету, то вам придется его восстановить.
Как продавцу учесть НДС при списании дебиторской задолженности по неоплаченным товарам, работам, услугам
При списании дебиторской задолженности начисленный НДС по отгруженным, но не оплаченным товарам (работам, услугам) к вычету принимать нельзя.
Если по налогу на прибыль вы применяете метод начисления, то этот НДС при списании дебиторской задолженности учитывайте так же, как и саму задолженность — включайте во внереализационные расходы либо покрывайте за счет резерва по сомнительным долгам (пп. 2 п. 2 ст. 265, п. 5 ст. 266 НК РФ, Письма Минфина России от 11.06.2013 N 03-03-06/1/21726, от 21.10.2008 N 03-03-06/1/596).
Как покупателю учесть «входной» НДС с аванса при списании дебиторской задолженности по неполученным товарам, работам, услугам
Если по налогу на прибыль вы применяете метод начисления, то при списании дебиторской задолженности «входной» НДС с аванса, который уплатили продавцу за товары (работы, услуги), включайте во внереализационные расходы или покрывайте за счет резерва по сомнительным долгам, как и основную сумму долга (пп. 2 п. 2 ст. 265, п. 5 ст. 266 НК РФ, Письма Минфина России от 11.06.2013 N 03-03-06/1/21726, от 21.10.2008 N 03-03-06/1/596).
При списании дебиторской задолженности восстановите «входной» НДС по авансу, если вы принимали его к вычету (Письма Минфина России от 05.06.2018 N 03-07-11/38251, от 23.06.2016 N 03-07-11/36478, от 13.08.2015 N 03-07-11/46703, от 23.01.2015 N 03-07-11/69652).
В судебной практике есть мнение, что восстанавливать «входной» НДС по выданному авансу при списании дебиторской задолженности не нужно, так как это не предусмотрено п. 3 ст. 170 НК РФ (см., например, Постановление Арбитражного суда Западно-Сибирского округа от 12.03.2018 N Ф04-6237/2017). Однако, если вы будете руководствоваться данной позицией, это может привести к спору с налоговым органом.